四、需要重点关注的几个问题
1.需要做好多区域共性与特性问题研究。
多区域的同质性是建设跨行政区创新体系的基础，也是推动跨行政区创新体系建设的重要力量，搞好多区域共性问题的研究，有利于找到推动跨行政区创新体系建设的真正动力。而区域特性问题研究是解决跨行政区创新体系建设过程中障碍的基础，多区域共同的特性问题以及各地区特性问题需要区别对待。
以东北三省为例，普遍存在着一系列共同的问题:科技与经济两张皮的“断裂症”;创新主体缺乏的问题;技术改造的副作用问题;技术引进的依赖性问题;主导产业竞争力不强的问题;创新动力不足、自主性不强的问题(是一种他组织行为);意识问题等。同时，东北三省的创新融合具有其独有的特征，必须区别对待:珠三角是一个省内的融合;长三角地区的融合中上海是龙头，部分江浙地区是其经济腹地;京津冀地区中北京是其名副其实的创新核，具有较强的协调能力。东北创新融合是三个独立而且实力差别不大的省份的融合，组织协调的难度要远远大于珠三角、长三角和京津冀地区。认真研究东北地区的共性问题与特性问题是加快东北区域创新体系建设的重要基础。
2.需要建立强有力的跨行政区创新体系协调机构。
在跨行政区创新体系建设与运行初期政府力量十分重要，特别是对创新的多区域创新融合有着巨大的推动作用。建立强有力的跨行政区创新体系协调机构有利于建立形成互惠互利的利益分配机制、打破区域壁垒等，并能进一步加速跨行政区共同的各项规划与计划的制定和发布，能够更有效地统一提供国内外市场信息，统一对外宣传，为跨行政区创新体系各区的企业寻找国际合作伙伴，提供各区企业的技术开发信息和技术可获性信息(1)等。
3.需要加速互通互连基础设施与服务体系建设。
互通互连的基础设施是加速区域创新联合的基础，加快跨行政区创新体系建设、提高跨行政区创新体系运行效率需要加快铁路、公路等交通基础设施的统一协调与建设，保证各创新主体的通达性与互通性;要特别加强信息通信基础设施的建设，(2)加快跨行政区信息高速公路的建设，加快跨行政区信息交流，提高信息利用效率。
【注释】
(1)European Commission. Methodology for Regional and Transnational Technology Clusters: Learning with European Best Practices［R］. 2001.3.
(2)Philip Cook et al. Regional innovation system: Institutional and organizational dimensions［J］. Research Policy.1997(26): 475－491.